Los campeonatos de divisiones juveniles de PRIMERA DIVISIÓN (históricamente denominadas "divisiones inferiores") inician su disputa en el comienzo del siglo XX. La CUARTA DIVISIÓN juega sus torneos desde el año 1901 (fue la tercera categoría abierta al cabo de tres años, ya que se jugaban hasta ese año los torneos de PRIMERA y SEGUNDA). Un año antes  se disputó un torneo organizado por la Association Football League ,del cual podían participar menores de 17 años, el cual se denominó "TERCERA DIVISIÓN". Al crearse esta categoría se dispuso que los clubes con nombres de institutos educacionales debían cambiarlo, porque tales denominaciones podrían interpretarse como una propaganda incompatible con las finalidades del deporte amateur.  El investigador Jorge Iwanczuk sostiene que el cambio también se debió a que la actuación con nombres de colegios podría llegar a interpretarse como una justa despareja ente escolares y deportistas. Así, como ejemplo, ENGLISH HIGH SCHOLL ATHLETIC CLUB pasa a llamarse ALUMNI ATHLETIC CLUB.
En 1912 comenzó a jugarse la QUINTA DIVISIÓN, iniciado por la Federación Argentina de Football. Podían participar jugadores que en el año cumplieran 17 años (CUARTA) y 15 años (QUINTA).
Con el correr de los años se fueron agregando el resto de las divisiones, hasta lograr, en 1950, un formato similar al actual (de 4ta a 9na, si bien en varias temporadas la 9na no tuvo torneo propio).
En cuanto al fútbol juvenil del ascenso, la organización de los torneos fue atravesando distintos cambios a lo largo de las temporadas:
* PRIMERA B: disputó durante muchos años solamente dos / tres divisiones anuales de los torneos de divisiones juveniles. En 1971 comenzó a jugar torneos de 4ta, 5ta, 6ta y 8va. Desde 1987 a 1996, al crearse el torneo del NACIONAL B, ambas categorías jugaron juntas (4ta, 5ta, 6ta y 7ma). En 1997 la PRIMERA B comenzó a organizar nuevamente sus propios torneos (siempre con 4 divisiones). En el año 2001 y hasta la actualidad las 6 divisiones (4ta a 9na) juegan su torneo anual.
* La PRIMERA C (llamada TERCERA DIVISIÓN hasta 1949 y SEGUNDA DIVISION hasta 1962, año cuando adopta el nombre de PRIMERA C), disputó durante muchos años campeonatos sólo en 5ta y 7ma. división. Fue en 2001 cuando pasó a jugar 4 divisiones (4ta, 5ta, 6ta y 7ma). Y en 2006 comienza a disputar torneos en las 6 divisiones (4ta a 9na), lo que sucede en la actualidad.
* La PRIMERA D (antes de denominada como TERCERA y luego como FUTBOL AFICIONADO) disputó durante varias temporadas torneos de TERCERA y de una o dos divisiones de juveniles. Recién fue en el año 2006 cuando las instituciones que participan de la divisional, organizaron junto a la PRIMERA C el torneo con 6 divisiones, es decir de 4ta a 9na, denominado JUVENILES CD.
* El NACIONAL B, en tanto, tuvo torneo propio de juveniles desde la temporada 1986/87 hasta el 2002 (en algunos de esos años conjuntamente a los equipos de Primera B). Desde el 2003 hasta el 2016 varias instituciones del NACIONAL B jugaron los torneos de JUVENILES de 1ra, hasta que en 2017 volvió a disputarse el campeonato de JUVENILES del NACIONAL B en forma independiente a las demás categorías, con la participación de algunos equipos invitados de los Torneos Federales.

Fútbol Juvenil
4º División: Para jugadores que no cumplan más de 20 años al 31 de diciembre del año respectivo.
5º División: Para jugadores que no cumplan más de 18 años al 31 de diciembre del año respectivo.
6º División: Para jugadores que no cumplan más de 17 años al 31 de diciembre del año respectivo.
7º División: Para jugadores que no cumplan más de 16 años al 31 de diciembre del año respectivo.
8º División: Para jugadores que no cumplan más de 15 años al 31 de diciembre del año respectivo.
9º División: Para jugadores que no cumplan más de 14 años al 31 de diciembre del año respectivo.

San Lorenzo en su historia logro los siguientes titulo de campeón en inferiores:
Intermedia: 1921 y 1922.
Segunda: 1939.
División Reserva: 1922 y 1924, 1939, 1940, 1947, 1948, 1953, 1954, 1969, 1970, 1996/97, 1998/1999, 2015 y 2018/19, 2019 copa de la Superliga.
Nota: Entre 1971 y 1980 se dejó de disputar, volviéndose a jugar a partir de 1981.
Tercera División: 1917, 1927, 1935, 1944, 1947, 1957, 1959, 1963 y Metro 1972.
Cuarta División: 1924, 1932, 1941, 1945, 1963, 1982 (Primera B), Torneo Especial 1987 y 2014..
Quinta División: 1934, 1936, 1939, 1967 ,1988 y 2015..
Sexta División: 1961, 1980, 1982 (Primera B), 1986, Torneo Especial 1987, Clausura 2001 y 2006..
Séptima División: 1955, 1960,1964, 1968, 1970, 1992, Apertura 2004, 2006, 2011,  2013 y 2021..
Octava División: 1950, 1960, 1956, 1965, 1969, 1972, 1978 y Clausura 2000..
Novena División: 1962, 1963, 1968, 1977, Apertura 1999, Clausura 1999 y Clausura 2000.
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El Club comenzó su desarrollo en esta área de manera paralela con el crecimiento de la entidad y el fútbol superior, cosechando también desde los primeros años una serie de títulos importantes. Hasta 1949, ocuparon una función formativa, la Cuarta "A" y "B", y la Quinta "A" y "B". Esporádicamente, la entidad dispuso de Equipos "C" o de la Cuarta Especial. Desde mediados del Siglo XX, el fútbol menor al margen de la Reserva, ya organizó sus categorías entre la Cuarta y Novena División, a lo que se agregó el fútbol infantil a partir de 1985.

Títulos de San Lorenzo en la Liga Metropolitana.
1999 (4): Categorías 1987, 1988, 1989 y 1990. .
2002 (3): Categorías 1988, 1990 y 1991. .
2003 (4): Categorías 1988, 1989, 1991 y 1993. .
2004 (3): Categorías 1989, 1993 y 1994. .
2015 (1): Categoría 1999.

Además, el Club obtuvo la Copa Challenguer 2006 al mejor equipo del año. Inclusive, varios de sus equipos salieron al extranjero y en ese ámbito, su mayor logro resultó la Dallas Cup en Estados Unidos durante 1998. .
En Infantiles, el Club sumó 7 títulos entre todas sus categorías, en las campañas de 1995, 1998 (dos veces), 2002, 2004, 2005 y 2006.