Con tan solo 17 años, Mauro comenzaba a dar sus primeros pasos en la Liga Chascomunense. En su primer campeonato con el LEFU (Lezama Fútbol Club) se coronaba campeón y goleador del torneo con 12 goles, Luego de la consagración de este equipo de solo 10 años de trayectoria marcó 8 goles en 12 partidos en el Torneo Argentino B.

Comenzó su carrera como futbolista profesional en Justo José de Urquiza, de la Primera C, en 2006. Jugó allí solo por una temporada, la 2006/07, cuando el Celeste llegó a disputar el Torneo Reducido, cayendo en Cuartos de final frente a General Lamadrid por 3-4, luego de empatar 0-0 en los 90 minutos reglamentarios y en los 30 del tiempo suplementario.​ En aquella temporada disputó 37 partidos y marcó 17 goles.

El 4 de febrero de 2014 es transferido a San Lorenzo por $2.800.000 por el 40% de la ficha que era propiedad de All Boys, y firma un contrato por dos años y medio, donde cosechó el mayor logro deportivo de su carrera y de la historia del club, la Copa Libertadores, convirtiendo el gol del empate en el partido de ida en Asunción frente a Nacional, obteniendo también la clasificación al Mundial de Clubes 2014. En diciembre del 2014, San Lorenzo enfrentó al Auckland City. El partido finalizó el primer tiempo 1-1 con un flojo partido del conjunto de Bauza. Luego Matos entró en el segundo tiempo, en el primer tiempo extra y logra establecer el 2-1 favorable para los de Boedo, dándole más tarde la victoria al Ciclón.

Síntesis del debut:

Martes 11 de febrero de 2014
BOTAFOGO DE BRASIL: 2   SAN LORENZO: 0
BOTAFOGO: Jefferson; Edilson, Bolivar, Doria, Julio Cesar; Gabriel, M.Mattos, Jorge Wagner; Lodeiro, Wallyson; Ferreyra. DT: Hungaro.
SAN LORENZO: Torrico; Buffarini, Cetto, Gentiletti, Mas; Kalinski, Mercier, Ortigoza, Piatti; Correa, Blandi. DT: Bauza.
Goles: PT: 29m. Ferreyra (B).
             ST:  7m. Wallyson (B).
Juez: Roberto Silvera de Uruguay.
Cancha: Maracaná de Rio de Janeiro
Cambios: Henrique por Ferreyra; Bolatti por Wallyson; Juniors Cesar por Lodeiro (B). Romagnoli por Kaliski; Matos por Blandi; Villalba por Piatti (SL)